Ti sei mai chiesto perché alcune persone potrebbero ammalarsi più di altre, anche quando prendono lo stesso virus? Non è ancora chiaro perché sia così. Fattori virali (come le differenze nel ceppo di un virus) svolgono un ruolo in questa variabilità, ma non possono spiegare l’ampia gamma di risposte in diversi individui infettati dallo stesso virus. Un numero di fattori dell’ospite sono stati presi in considerazione anche l’immunità preesistente, l’età, il sesso, il peso e il microbioma.
Un altro fattore importante è la biologia molecolare all’interno delle cellule. Il DNA è mostrato come un lungo filamento a doppia elica. Quindi, ci si potrebbe aspettare che la cellula legga sempre le informazioni genetiche in ordine, partendo da un’estremità e andando all’altra. Ma non è così. Il DNA contiene elementi trasponibili a volte chiamato “DNA spazzatura”, che può cambiare le regioni del genoma che vengono lette in un dato momento.
L’opera pubblicata in Genomica cellulare da un team internazionale guidato dal Dr. Guillaume Bourque, che ha studiato il ruolo di questi elementi trasponibili sulla gravità della malattia dopo l’infezione da virus dell’influenza A.
Esaminando i dati di 39 individui prima e dopo l’infezione da virus dell’influenza A, i ricercatori sono stati in grado di identificare i cambiamenti nell’accessibilità (ovvero la “leggibilità”) degli elementi trasponibili. Per fare ciò, i ricercatori hanno utilizzato un approccio che combina vari set di dati multiomici, che caratterizzano e quantificano le raccolte di biomolecole nelle cellule o negli organismi. Uno era il trascrittoma, che consiste in tutte le copie di RNA trascritte dal DNA nella cellula. L’altro era l’epigenoma, che è la raccolta di cambiamenti chimici nel DNA che modificano l’espressione genica. Un vantaggio di questo approccio multiomico è che sono stati in grado di identificare famiglie di elementi trasponibili con modifiche nell’accessibilità, che probabilmente sarebbero state perse dagli approcci precedenti.
Considerando questi cambiamenti negli elementi trasponibili dopo l’infezione virale, potrebbero identificare diversi fattori di trascrizione (proteine che attivano o disattivano geni specifici) che probabilmente contribuiscono alla risposta di qualcuno all’infezione. Utilizzando questi risultati, i ricercatori sono stati in grado di creare un modello in grado di prevedere la carica virale di un individuo dopo l’infezione da influenza A.
“Rimangono alcune domande, ad esempio se il legame tra elementi trasponibili e carica virale sia effettivamente causale e se questi cambiamenti sarebbero coerenti nel tempo”, afferma l’autore principale Xun Chen. “Ma questi risultati sono un passo importante verso la comprensione del ruolo che tali fattori giocano nella variabilità della gravità della malattia tra gli individui”.
Gli autori includono ricercatori dell’Università di Kyoto in Giappone, della McGill University e dell’Université de Montréal in Canada e dell’Università di Chicago negli Stati Uniti.
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