Un nuovo studio mostra l’isolamento e il sequenziamento di molecole di RNA di oltre un secolo provenienti da un esemplare di tigre della Tasmania conservato a temperatura ambiente nella collezione di un museo. Ciò ha portato per la prima volta alla ricostruzione dei trascrittomi della pelle e dei muscoli scheletrici di una specie estinta. I ricercatori sottolineano che le loro scoperte hanno implicazioni rilevanti per gli sforzi internazionali volti a resuscitare specie estinte, tra cui sia la tigre della Tasmania che il mammut lanoso, nonché per lo studio dei virus pandemici a RNA.
La tigre della Tasmania, conosciuta anche come tilacino, era un notevole marsupiale carnivoro apicale che un tempo era distribuito in tutto il continente australiano e nell’isola della Tasmania. Questa straordinaria specie trovò la sua scomparsa definitiva dopo la colonizzazione europea, quando fu dichiarata un parassita agricolo e nel 1888 fu fissata una taglia di £ 1 per ogni animale adulto ucciso. L’ultima tigre della Tasmania vivente conosciuta morì in cattività nel 1936 Zoo di Beaumaris a Hobart, Tasmania.
I recenti sforzi per la deestinzione si sono concentrati sulla tigre della Tasmania, poiché il suo habitat naturale in Tasmania è ancora in gran parte preservato, e la sua reintroduzione potrebbe aiutare a ripristinare gli equilibri ecosistemici del passato persi dopo la sua scomparsa definitiva. Tuttavia, ricostruire una tigre della Tasmania vivente e funzionale non richiede solo una conoscenza completa del suo genoma (DNA), ma anche delle dinamiche di espressione genetica tessuto-specifiche e del modo in cui funzionava la regolazione genetica, ottenibili solo studiando il suo trascrittoma (RNA).
“Resuscitare la tigre della Tasmania o il mammut lanoso non è un compito banale, e richiederà una profonda conoscenza sia del genoma che della regolazione del trascrittoma di specie così rinomate, qualcosa che solo ora comincia a essere rivelato,” dice Emilio Mármol, il responsabile autore di uno studio recentemente pubblicato sulla rivista Genome Research dai ricercatori di SciLifeLab in collaborazione con il Center for Palaeogenetics, una joint venture tra il Museo svedese di storia naturale e l’Università di Stoccolma.
Molecole di RNA recuperate dalla tigre della Tasmania
I ricercatori dietro questo studio hanno sequenziato, per la prima volta, il trascrittoma della pelle e dei tessuti muscolari scheletrici di un esemplare essiccato di tigre della Tasmania di 130 anni conservato a temperatura ambiente nel Museo svedese di storia naturale di Stoccolma. Ciò ha portato all’identificazione di firme di espressione genica tessuto-specifiche che assomigliano a quelle dei mammiferi marsupiali e placentari esistenti.
I trascrittomi recuperati erano di qualità così buona che è stato possibile identificare RNA codificanti proteine specifiche del muscolo e della pelle e hanno portato all’annotazione dei geni mancanti dell’RNA ribosomiale e dei microRNA, questi ultimi seguendo le raccomandazioni di MirGeneDB.
“Questa è la prima volta che riusciamo a intravedere l’esistenza di geni regolatori specifici del tilacino, come i microRNA, che si sono estinti più di un secolo fa”, afferma Marc R. Friedländer, professore associato presso il Dipartimento di Bioscienze Molecolari. , Il Wenner-Gren Institute dell’Università di Stoccolma e SciLifeLab.
Questo studio pionieristico apre nuove entusiasmanti opportunità e implicazioni per l’esplorazione delle vaste collezioni di campioni e tessuti conservati nei musei di tutto il mondo, dove le molecole di RNA potrebbero attendere di essere scoperte e sequenziate.
“In futuro, potremmo essere in grado di recuperare l’RNA non solo da animali estinti, ma anche genomi di virus a RNA come SARS-CoV2 e i loro precursori evolutivi dalla pelle di pipistrelli e altri organismi ospiti conservati nelle collezioni dei musei”, afferma Love Dalén. , Professore di genomica evolutiva all’Università di Stoccolma e al Centro di Paleogenetica.
Gli autori dello studio si dicono entusiasti per i futuri sviluppi della ricerca olistica che integrino sia la genomica che la trascrittomica verso una nuova era nella paleogenetica oltre il DNA.
Da un’altra testata giornalistica. news de www.sciencedaily.com
