I ricercatori della North Carolina State University hanno utilizzato l’analisi del testo su scritti sia storici che moderni per rivelare maggiori informazioni sugli effetti e sulla diffusione del patogeno vegetale – ora noto come Phytophthora infestans – che causò la carestia irlandese delle patate nel 1840 e che continua a irritare gli allevatori di patate. patate e pomodori.
Lo studio ha esaminato termini chiave come “marciume della patata” e “malattia della patata” dopo aver digitalizzato resoconti agricoli storici, resoconti di notizie e documenti agricoli dell’Ufficio Brevetti degli Stati Uniti dal 1843 al 1845 per mostrare come l’agente patogeno si diffuse per la prima volta negli Stati Uniti nordorientali prima di causare la devastante carestia. in Irlanda nel 1845. Lo studio ha utilizzato anche l’analisi del testo per tenere traccia dei feed dei social media per la diffusione moderna della peronospora.
L’analisi testuale è promettente come strumento utile per aiutare i ricercatori a monitorare e visualizzare le malattie delle piante sia storiche che attuali, dicono i ricercatori.
“Siamo tornati alle descrizioni originali delle epidemie della malattia della patata negli Stati Uniti perché si sono verificate tra il 1843 e il 1845, prima che si verificassero epidemie in Europa”, afferma Jean Ristaino, professore di patologia vegetale William Neal Reynolds presso la North Carolina State University e corrispondente autore di un articolo in Rapporti scientifici che descrive lo studio. “Abbiamo cercato quelle descrizioni per parole chiave e, così facendo, siamo stati in grado di ricreare le mappe originali dell’epidemia utilizzando le coordinate della posizione menzionate nei documenti.
“Stavamo anche cercando di capire cosa pensavano le persone della malattia in quel momento e da dove provenisse.”
L’analisi documenta la malattia della peronospora sulle patate in cinque stati – New York, Delaware, Massachusetts, New Jersey e Pennsylvania – prima che si diffondesse nel resto degli Stati Uniti nordorientali e in Canada tra il 1843 e il 1845. Europa, soprattutto Irlanda.
L’articolo ha inoltre esaminato i tweet dal 2012 al 2022 per saperne di più sulla diffusione moderna di P. infestans. Hanno estratto dai tweet i nomi comuni e scientifici dell’agente patogeno e sono stati in grado di geolocalizzare le fonti.
“L’estrazione dai social media è stata interessante perché abbiamo scoperto che la maggior parte delle persone che parlano di questa malattia sono scienziati dei paesi sviluppati che promuovono il proprio lavoro su Twitter (ora X)”, ha detto Ristaino. “È stato anche interessante notare che gli stati in cui la malattia è apparsa tanti anni fa hanno ancora la malattia adesso.”
Lo studio ha utilizzato anche i termini di ricerca di Google Ngram per rivelare una scoperta sorprendente. I ricercatori hanno notato un picco nella malattia della peronospora riportata nei documenti degli anni ’50. Analizzando la letteratura accademica citata nei documenti, Ristaino ha visto prove di una vasta epidemia di peronospora nei pomodori negli Stati Uniti dopo la seconda guerra mondiale.
“Ciò potrebbe essere stato l’emergere di un nuovo ceppo nordamericano dell’agente patogeno, noto come US 1, che in seguito si è diffuso molto”, ha detto Ristaino.
Ristaino ha aggiunto che lei e il suo team intendono continuare questo tipo di lavoro ed espandere gli strumenti analitici ad altre malattie delle piante e parassiti.
I coautori Ariel Saffer, Laura Tateosian e Yi-Peng Yang fanno parte del Centro per l’analisi geospaziale dello Stato NC. Anche Amanda C. Saville, una ricercatrice specializzata nel laboratorio di Ristaino, è stata coautrice dell’articolo. Il finanziamento è stato fornito dal Triangle Center for Evolutionary Medicine Seed Grant; NIFA del Dipartimento dell’Agricoltura degli Stati Uniti con il numero di sovvenzione 2015-2370; e dalla sovvenzione PIPP Fase 1 della National Science Foundation, numero 2022-1191.
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