Scegliere singole celle in immagini di microscopia distorte è ora facile come fare clic su un pulsante.
Una nuova versione di cellulare-lo strumento popolare che mappa i confini di diverse cellule nelle immagini di microscopia-ora funziona su immagini tutt’altro che perfette che sono rumorose, sfocate o sottocampionate.
Molti metodi generali utilizzati per segmentare singole cellule nelle immagini di microscopia, comprese le versioni precedenti di cellulare, hanno difficoltà a riconoscere i confini cellulari che sono stati distorti dal rumore, dal sfocatura o dalla sottocampionamento.
I leader del gruppo di Janelia Carsen Stringer e Marius Pachitariu hanno deciso di affrontare questo problema con lo sviluppo di Cellpose3. A differenza degli approcci precedenti, che allenano i modelli per migliorare la qualità delle immagini distorte, Cellpose3 è stato invece addestrato per migliorare la segmentazione di immagini distorte.
L’algoritmo di restauro di Cellpose3, quando applicato a immagini distorte, produce immagini restaurate nitide che possono quindi essere facilmente segmentate dall’algoritmo di segmentazione cellulare originale.
CellPose3 è anche addestrato su una grande raccolta di immagini, consentendo agli utenti di utilizzare facilmente il nuovo metodo, che è disponibile come pulsante “con un clic” nell’applicazione a cella, sui propri dati.
Da un’altra testata giornalistica. news de www.sciencedaily.com
