I ricercatori hanno sviluppato nanoparticelle in grado di penetrare nella retina neurale e fornire mRNA alle cellule dei fotorecettori il cui corretto funzionamento rende possibile la visione.

Gli scienziati dell’Oregon State University College of Pharmacy hanno dimostrato in modelli animali la possibilità di utilizzare nanoparticelle lipidiche e RNA messaggero, la tecnologia alla base dei vaccini COVID-19, per trattare la cecità associata a una rara condizione genetica.

Lo studio è stato pubblicato oggi (11 gennaio 2023) sulla rivista I progressi della scienza. È stato guidato dal professore associato di scienze farmaceutiche dell’OSU Gaurav Sahay, dallo studente di dottorato dell’Oregon State Marco Herrera-Barrera e dall’assistente professore di oftalmologia dell’Oregon Health & Science University Renee Ryals.

Gli scienziati hanno superato quella che era stata la principale limitazione dell’utilizzo di nanoparticelle lipidiche, o LNP, per trasportare materiale genetico ai fini della terapia della vista, facendole raggiungere la parte posteriore dell’occhio, dove si trova la retina.

I lipidi sono acidi grassi e composti organici simili tra cui molti oli e cere naturali. Le nanoparticelle sono minuscoli pezzi di materiale di dimensioni variabili da uno a 100 miliardesimi di metro. L’RNA messaggero fornisce istruzioni alle cellule per produrre una particolare proteina.

Con i vaccini contro il coronavirus, l’mRNA trasportato dagli LNP istruisce le cellule a creare un pezzo innocuo della proteina spike del virus, che innesca una risposta immunitaria dal corpo. Come terapia per la compromissione della vista derivante dalla degenerazione retinica ereditaria, o IRD, l’mRNA istruirebbe le cellule dei fotorecettori – difettose a causa di una mutazione genetica – a produrre le proteine ​​necessarie per la vista.

L’IRD comprende un gruppo di disturbi di varia gravità e prevalenza che colpiscono una persona su poche migliaia in tutto il mondo.

Gli scienziati hanno dimostrato, in una ricerca che ha coinvolto topi e primati non umani, che gli LNP dotati di peptidi erano in grado di passare attraverso le barriere negli occhi e raggiungere la retina neurale, dove la luce viene trasformata in segnali elettrici che il cervello converte in immagini.

“Abbiamo identificato un nuovo set di peptidi che possono raggiungere la parte posteriore dell’occhio”, ha detto Sahay. “Abbiamo usato questi peptidi per agire come codici postali per consegnare nanoparticelle che trasportano materiali genetici all’indirizzo previsto all’interno dell’occhio”.

“I peptidi che abbiamo scoperto possono essere usati come ligandi mirati direttamente coniugati a RNA silenzianti, piccole molecole per terapie o come sonde di imaging”, ha aggiunto Herrera-Barrera.

Sahay e Ryals hanno ricevuto una sovvenzione di 3,2 milioni di dollari dal National Eye Institute per continuare a studiare la promessa delle nanoparticelle lipidiche nel trattamento della cecità ereditaria. Condurranno la ricerca sull’uso degli LNP per fornire uno strumento di editing genetico che potrebbe eliminare i geni cattivi nelle cellule dei fotorecettori e sostituirli con geni correttamente funzionanti.

La ricerca mira a sviluppare soluzioni per le limitazioni associate all’attuale principale mezzo di consegna per l’editing genetico: un tipo di virus noto come virus adeno-associato o AAV.

“L’AAV ha una capacità di confezionamento limitata rispetto agli LNP e può provocare una risposta del sistema immunitario”, ha affermato Sahay. “Inoltre, non funziona in modo fantastico nel continuare a esprimere gli enzimi che lo strumento di modifica utilizza come forbici molecolari per eseguire tagli nel DNA da modificare. Speriamo di utilizzare ciò che abbiamo appreso finora sugli LNP per sviluppare un sistema di consegna dell’editor di geni migliorato”.

Riferimento: “Le nanoparticelle lipidiche guidate da peptidi forniscono mRNA alla retina neurale di roditori e primati non umani” 11 gennaio 2023, I progressi della scienza.
DOI: 10.1126/sciadv.add4623

Lo studio LNP guidato dai peptidi è stato finanziato dal National Institutes of Health. Hanno partecipato alla ricerca per l’Oregon State anche i docenti del College of Pharmacy Oleh Taratula e Conroy Sun, i ricercatori post-dottorato Milan Gautam e Mohit Gupta, gli studenti di dottorato Antony Jozic e Madeleine Landry, l’assistente di ricerca Chris Acosta e lo studente universitario Nick Jacomino, uno studente di bioingegneria al College di Ingegneria che si è laureata nel 2020.

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Scienze & AmbientePrimo modello di machine learning addestrato nello spazio

Primo modello di machine learning addestrato nello spazio

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Per la prima volta, i ricercatori hanno addestrato un modello di apprendimento automatico nello spazio, a bordo di un satellite. Questo risultato potrebbe consentire il monitoraggio e il processo decisionale in tempo reale per una vasta gamma di applicazioni, dalla gestione dei disastri alla deforestazione.

I dati raccolti dai satelliti di telerilevamento sono fondamentali per molte attività chiave, tra cui la mappatura aerea, le previsioni meteorologiche e il monitoraggio della deforestazione.

Attualmente, la maggior parte dei satelliti può raccogliere dati solo passivamente, poiché non sono attrezzati per prendere decisioni o rilevare modifiche. Invece, i dati devono essere trasmessi alla Terra per essere elaborati, il che in genere richiede diverse ore o addirittura giorni. Ciò limita la capacità di identificare e rispondere a eventi che emergono rapidamente, come i disastri naturali.

Rappresentazione artistica di un satellite GPS Block IIIA in orbita.  Dotare i satelliti di capacità di apprendimento automatico potrebbe consentire il monitoraggio in tempo reale, inclusi disastri naturali, condizioni meteorologiche estreme e deforestazione.

Rappresentazione artistica di un satellite GPS Block IIIA in orbita. Dotare i satelliti di capacità di apprendimento automatico potrebbe consentire il monitoraggio in tempo reale, inclusi disastri naturali, condizioni meteorologiche estreme e deforestazione. Credito immagine: USAF tramite Wikimedia, dominio pubblico

Per superare queste restrizioni, un gruppo di ricercatori guidati da DPhil student Vít Růžička (Dipartimento di Informatica, Università di Oxford), ha accettato la sfida di addestrare il primo programma di apprendimento automatico nello spazio.

Nel 2022, il team ha presentato con successo la propria idea al Sfrecciando attraverso la missione Starsche aveva pubblicato un bando aperto per proposte progettuali da realizzare a bordo del satellite ION SCV004, lanciato nel gennaio 2022. Nell’autunno del 2022, il team ha effettuato l’uplink del codice del programma al satellite già in orbita.

I ricercatori hanno addestrato un modello semplice per rilevare i cambiamenti nella copertura nuvolosa dalle immagini aeree direttamente a bordo del satellite, in contrasto con l’addestramento a terra.

Il modello era basato su un approccio chiamato apprendimento a pochi colpi, che consente a un modello di apprendere le caratteristiche più importanti da cercare quando ha solo pochi campioni da cui addestrarsi. Un vantaggio chiave è che i dati possono essere compressi in rappresentazioni più piccole, rendendo il modello più veloce ed efficiente.

Vít Růžička ha spiegato: ‘Il modello che abbiamo sviluppato, chiamato RaVAEn, prima comprime i file immagine di grandi dimensioni in vettori di 128 numeri. Durante la fase di addestramento, il modello impara a mantenere in questo vettore solo i valori informativi; quelli relativi al cambiamento che sta cercando di rilevare, in questo caso se è presente o meno una nuvola. Ciò si traduce in un addestramento estremamente rapido grazie all’avere solo un modello di classificazione molto piccolo da addestrare.’

Mentre la prima parte del modello, per comprimere le immagini appena viste, è stata addestrata a terra, la seconda parte (che decideva se l’immagine contenesse nuvole o meno) è stata addestrata direttamente sul satellite.

Normalmente, lo sviluppo di un modello di apprendimento automatico richiederebbe diversi cicli di formazione, utilizzando la potenza di un cluster di computer collegati. Al contrario, il minuscolo modello del team ha completato la fase di addestramento (utilizzando oltre 1300 immagini) in circa un secondo e mezzo.

Quando il team ha testato le prestazioni del modello su nuovi dati, ha rilevato automaticamente se un cloud era presente o meno in circa un decimo di secondo. Ciò ha comportato la codifica e l’analisi di una scena equivalente a un’area di circa 4,8 x 4,8 km2 (equivalente a quasi 450 campi da calcio).

Secondo i ricercatori, il modello potrebbe essere facilmente adattato per svolgere diversi compiti e per utilizzare altre forme di dati.

Vít Růžička ha aggiunto: “Dopo aver raggiunto questa dimostrazione, intendiamo ora sviluppare modelli più avanzati in grado di distinguere automaticamente tra cambiamenti di interesse (ad esempio inondazioni, incendi e deforestazione) e cambiamenti naturali (come cambiamenti naturali nel colore delle foglie durante le stagioni ). Un altro scopo è sviluppare modelli per dati più complessi, incluse immagini da satelliti iperspettrali. Ciò potrebbe consentire, ad esempio, il rilevamento di fughe di metano e avrebbe implicazioni fondamentali per la lotta al cambiamento climatico».

L’esecuzione dell’apprendimento automatico nello spazio potrebbe anche aiutare a superare il problema dei sensori satellitari di bordo che sono influenzati dalle difficili condizioni ambientali, in modo che richiedano una calibrazione regolare.

Vít Růžička ha dichiarato: “Il nostro sistema proposto potrebbe essere utilizzato in costellazioni di satelliti non omogenei, dove è possibile applicare informazioni affidabili da un satellite per addestrare il resto della costellazione. Questo potrebbe essere utilizzato, ad esempio, per ricalibrare i sensori che si sono degradati nel tempo o che hanno subito rapidi cambiamenti nell’ambiente.’

Illustrazione dei dati utilizzati per addestrare il modello di classificazione delle nuvole minuscole (a sinistra) e le previsioni su nuove scene (a destra).  L'intero processo di addestramento ha richiesto circa 1,5 secondi, incluso il tempo per la codifica del set di dati di addestramento completo e 10 epoche di addestramento di un modello di classificazione.

Illustrazione dei dati utilizzati per addestrare il modello di classificazione delle nuvole minuscole (a sinistra) e le previsioni su nuove scene (a destra). L’intero processo di addestramento ha richiesto circa 1,5 secondi, incluso il tempo per la codifica del set di dati di addestramento completo e 10 epoche di addestramento di un modello di classificazione. Credito immagine: dati Sentinel-2 (ESA) elaborati da Vít Růžička.

Questo progetto è stato riassunto in una pubblicazione prestampata “Fast model inference and training on-board of Satellites” disponibile all’indirizzo arXiv. Il lavoro è stato anche presentato alla conferenza International Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS) il 21 luglio 2023.

Questo progetto è stato condotto in collaborazione con l’Agenzia Spaziale Europea (ESA) Φ-lab attraverso la campagna Cognitive Cloud Computing in Space (3CS) e l’iniziativa Trillium Technologies Networked Intelligence in Space (NIO.spazio) e partner di D-Orbit e Unibap.

Fonte: università di Oxford



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